低氧/厌氧产品案例——微细菌研究

文章题目：Microbacterium paulum sp. nov., isolated from microfiltered milk泡乳微菌：从微过滤牛奶中分离
文章出处： Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(11):10.1099/ijsem.0.005119；意大利圣库雷大教堂可持续食品加工部
工作站使用情况：Concept 400
使用气体浓度：厌氧

摘要：一种新的革兰氏染色阳性，严格需氧，短杆状细菌，命名为 2CT，从新鲜包装老化的微过滤牛奶中分离。该菌株能够在 0–5%(w/v)的 NaCl 浓度范围、8–37°C 的温度范围(最佳温度为 30°C)和 pH 6.0–10.0 下生长。基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析表明，菌株 2CT 与细杆菌属 lacticum DSM 20427T 以及黄色微杆菌 DSM 18909T (=YM18-098T)序列相似性最高(99.2%)。基于 16S rRNA 基因的系统进化树显示菌株 2CT 与 18909T 最近。然而，基于串联的 16S rRNA 和 4 个管家基因的系统进化树显示菌株 2CT 与 20427T 最近。此外，菌株 2CT 显示乙醇酰基型细胞壁。基因组 DNA G+C 含量为 69.8 mol%，而平均核苷酸同一性(ANI)和数字 DNA-DNA 杂交(dDDH)值与之密切相关细杆菌属物种定义低于公认的 95–96% ANI 和 70% DDH 阈值。基于表型和基因型数据，菌株 2CT (=LMG 32277T=CECT 30329T)被认为代表了一个新物种，命名为泡菌属。

总结：菌株 2CT 与微杆菌属近缘种类型株的最大似然系统发育树（图 1）；系统发育分析表明，乳杆菌属选择 DSM 20427T 和 M. flavum DSM 18909T 作为表型参考菌株。
菌株 2CT、乳酸杆菌 M. lacticum DSM 20427T 与菌株 M. flavum DSM 18909T 在厌氧室
(Ruskinn，Concept-400)中于 30℃孵育 10 天，以评估厌氧条件下的生长；结果表明，菌株 2CT 是严格需氧的，革兰氏染色阳性，短杆状(如图 4)；
基于表型和基因型数据，菌株 2CT (=LMG 32277T=CECT 30329T)被认为代表了一个新物种，命名为泡菌属。

文章链接：https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.005119